三江口回广州，周士相立即进整军，首先便令各部统计兵马，计兵21500，青壮民夫14000。其降兵数10600，备兵连辎重营兵5500，原属太平军步军左右二营、新兵营战兵5000左右。
回广州路，周士相已经何整军扩军，将太平军设立四镇，各部挑选精兵编入、二镇，剩余编三镇，余则四镇。
镇编制具体:20兵伍，设伍正名、衔旗；3伍队，设队正名、衔旗官；队辖3伍分别甲乙丙命名，队正设直属兵十员，掌扈卫、旗鼓号令，另设伙兵5员，故队兵额75；3队卫，设卫尉名，衔百户，卫辖队甲乙丙名，卫正直属兵20员，称卫兵，掌扈卫、旗鼓号令，故卫兵额245.
3卫营，设营尉名，衔千户。营辖卫甲乙丙名，营尉设直属兵40员，称营兵，掌扈卫、旗鼓号令，故营兵额775；3营旅，设旅校名，衔指挥知；营甲乙丙名，旅尉设直属兵100员，称旅兵，掌扈卫、旗鼓；故营兵额2425。
3旅镇，设镇将名，衔指挥使。镇辖旅甲乙丙名，镇将设直属兵300员，称镇兵，掌扈卫、旗鼓号令；故镇兵7575。
此次改编体亦香山军制，旅帅、师帅改旅校、镇将，营官称营尉，卫官称卫尉。每队设队副2名，旗衔，其安军使；每卫设副卫尉2名，试百户衔，其安军使；每营设副营尉2名，百户衔，其安军使；每旅设副校2名，千户衔，其安军使；镇将设副将2名，指挥知衔，安军使由镇将亲领。
镇将暂拟等兵官，旅校等参将，营尉等游击，卫尉等千，队正等。正式任命待报请永历朝廷方落实，周士相眼广州兵官名义权知任。
老卒善战者，称锐兵；新入军者，称选兵；乡待选者（保安队），称备兵。太平军制，锐兵、选兵正兵，其额缺者，备兵补，备兵入营，则选兵。
步军四镇外再设马兵旅，称骑兵旅，其旅建制等步军镇。官兵名额亦，旅兵2425；旅校设直属兵，兵员亦锐兵、选兵分。
再设炮兵营，营制等步军镇，官兵名额5000，兵分正炮、副炮、辅炮，等锐兵、选兵、备兵。正炮操炮，副炮架炮，辅炮运炮。
四镇步军、马军旅编，即由镇进驻清远，二镇驻广州，三镇驻增城，四镇驻香山，马军旅炮营驻广州。城外越秀山设广州营。
镇将选别分镇葛义，二镇铁毅，三镇蒋，四镇邵九公。骑兵旅由邵掌，满州苏纳掌副。炮营镇将齐豪担任。
镇二镇太平军降兵挑选精锐组，太平军四镇打两镇，两镇求，周士相，战斗力绝低，因随拉清军见仗。因此两镇镇将选选葛义铁毅，此二皆勇猛，适合冲锋陷阵。秃蒋勇将，匪气比葛义重，且爱喝酒，周士相怕喝酒误，因此将三镇给。邵九公忠诚足够，却勇猛风，做顾头顾尾，敢豁拼，属持重型，因此周士相将四镇给。
、二镇今清军战主力量，三、四镇则稳定方，此镇将选区别。炮镇攻击力量，战随镇、二镇活。周士相拟炮兵规模扩，即每镇军设炮旅，加强步军镇火力攻击。
靖南藩汉军平南藩汉军半选入镇，镇将军官任命相互挟制，平南藩降将任靖南藩降兵队正、卫尉，靖南藩降将任平南藩降兵队正、卫尉。原先两藩麾将领协领军官全部被落兵备讲武堂充教官，或改文官，低级武官任职。两镇军官任命营尉军官太平军身，营尉降将占半。
原先香山永乐乡水营调至广州，珠江原清军水师驻长洲岛设太平军水营，此即几百黄埔军校。
水营兵额暂定5000，因水营缺少战船，短间法承担战任务，故周士相请凌海将军陈奇策调遣部水师战船部移至长洲岛，确保珠江明军。陈奇策部水师提供粮草供应，并遣向习水师战法。
已朱统占肇庆陈奇策爽快答应周士相请求，派偏将郑魁领40余艘战船进驻长洲岛，并送给太平军12艘战船。此举让周士相喜望，12艘战船虽很少，却味水营再内河水师，够珠江甚至狮洋“海军”。
【话，目朗读听书app，换源app， 安装新版。】
水营镇将由周士相亲领，给宋襄公压任务，让论何内建太平军造船厂，迟两内太平军必须够造战船水。强郑氏水师直周士相眼红，妒忌象，奈何水师太吃银，太耗精力间，且眼决定战场力量，故周士相先展步军，待取南方数省或江南全部，方再进“海军”组建。
周士相广州平南王府立军帅府，设亲兵，选全军身高1米七锐兵充任，选800，制铁甲，号铁卫。铁卫指挥由瞎李担任，职参将衔。
军帅府设军、民两部，军部由赵四海负责，民部由宋襄公负责，宋襄公亦兼广东布政使，，任命永历朝廷背书，乃周士相。按制，法任命官员，况省布政使。再者，钦州督衙门，高州四府巡抚，论怎排，轮周士相控广东布政使司衙门。
鉴太平军识字率太低，短间组织全军次“扫盲”运，因此邵九公等建议，周士相原靖南将军府建兵备讲习，各镇伍长军官轮批分批入堂教，制三月，主由仿世军队操典改编《太平军步军操典》，该操典涉及初步军队整训、操练、旗号鼓等。
四镇旅两营编制定，即由军帅府主持调兵建。间，广州附近处兵马调，往东往东，往西往西，闹哄哄，直七八间才将各部集结位，军官落实明确。此期间，周士相很少睡觉，瞪红眼听取各部汇报，唯恐调期间降兵乱。
军队编制落实，周士相定军饷。锐兵定军饷月银1银，眷由太平军公库供养；选兵定月银，眷由太平军公库供养；备兵饷银领，其训练期间武器装备由太平军拨给，训练期间农田由各村公组织帮助耕，减轻其庭负担。
军官饷银伍正2两月，24两，队正者依次提百分二十。战功者，论官兵另获赏赐，或银，或粮，或物，或土。
各镇立，周士相即叫宋襄公公库犒赏三军将士，并且主持实际控制区内土整并。
广州城汉军眷被分三批安置，批拨入山寨，批拨入仁厚乡，批安置番禺。汉军眷安置，由划拨土供耕，太平军老营，分别设村管治。太平军提供初期活需农具、，切需食其力，待其男军服役满三才享受太平军眷待遇。
4000满州妇被广州城赶安置香山，由乡、村公择配夫，汉军眷食其力。满州妇广州城内百姓太平军将士青睐，送乡却抢货，月被男分抢空。
宋襄公任广东布政使，降官王章钧布政使司右参政，左清左参政。广州知府由廖瑞祥接任，香山知县则给尚未回龙眼乡盐课使郭绍。台山回徐应元则军帅府参议位置。
广东布政使司衙门件办，落实太平军实际控制区域内乡、村公组建，将力资源效整合。各驻太平军除抓紧操练外，件办，剿匪。