尼布楚条约签订二，沙俄政府唆使准噶尔部（蒙古族支）首领噶尔丹进攻漠北蒙古。
准噶尔漠西蒙古支，噶尔丹统治准噶尔部，野**，先兼并漠西蒙古其部落，向东进攻漠北蒙古。几十万漠北蒙古逃漠南，请求清朝政府保护。康熙帝派使者噶尔丹，叫侵占方给漠北蒙古。噶尔丹沙俄撑腰，十分骄横，肯退兵，追击漠北蒙古名，举进犯漠南。
康熙帝召集臣宣布决定亲征噶尔丹。公元1690，康熙帝分兵两路：左路由抚远将军福全率领，古北口；右路由安北将军常宁率领，喜峰口，康熙帝亲带兵指挥。
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清军胜利，噶尔丹带残兵逃漠北。回漠北，噶尔丹，表向清朝政府表示屈服，暗重新招兵买马。公元1694，内蒙古各部亲王纷纷向康熙帝揭露噶尔丹野。
公元1696，康熙帝二次亲征，分三路击，，噶尔丹带几十名骑兵脱逃。
经两次战，噶尔丹判乱集团土崩瓦解，康熙帝噶尔丹投降，噶尔丹继续顽抗。
隔，康熙帝带兵渡黄河亲征。噶尔丹走投路，服毒杀。
清朝政府三征噶尔丹，重新控制阿尔泰山东漠北蒙古，给蒙古贵族各封号官职。清政府乌雅苏台设立将军，统辖漠北蒙古。