1653(永历七)五月初，郑功回师海澄，派遣甘辉守关帝庙木栅镇远楼间，郑功率亲军驻守妃宫，与固山金砺决战。清军铳炮攻木栅，郑军死伤。
五月五，郑功率领麾将领敌台观战，居打仪仗！清军立刻向台炮，甘辉见势妙，强拖郑功高台！刚离，郑功座位被击碎！
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此战固山金砺师劳功，兵卒被歼灭，撤退。永历帝诏封甘辉崇明伯、评功甘辉，升任督。
1659(永历十三)五月，郑功举北伐，声势浩。七月攻战焦山(今江苏省镇江市东北)，此祭百神及洪武、崇祯、隆武诸帝，军振。
功督亲军及督甘辉等直捣瓜洲(镇名，称瓜埠洲，江苏省邗江县南部)，尽歼清将朱衣祚军万余。随即郑军进迫镇江，败清提督管效忠数万师，管仅身免。镇江守将高谦、知府戴进等降。
甘辉向郑功建议：“瓜(洲)、镇(江)南北咽喉，坐镇此，断瓜洲，则山东师；据北固，则两浙路通，南劳定矣。”
郑功采纳，率师直攻南京，清军南京守将郎廷佐拖延间等待清军回援，诈降郑功。甘辉却破计谋，郑功速攻，敌缓兵计。结果郑功听。锋营余新更轻敌，居放纵士兵捕鱼，毫防备。
等二十夜，清军援军达。清将梁化凤由仪凤门城偷袭，余新仓皇应战，战败被擒，锋营全营被歼灭！二十三，清军队抄山，击败左先锋杨宜。郑军增援，结果被清军山往逼，郑军势利败！迫使郑功撤退。由仓促，舟船足，郑军争夺船，相残杀。甘辉掩护全军断。且战且退直退江边，身边仅剩30余。甘辉率部击杀清军百，战马力疲被绊倒，甘辉被俘。
甘辉与万礼、余新被解至南京，清两江督郎廷佐与固山金砺审。甘辉挺立跪，万礼、余新皆跪，甘辉足蹴，：“傻，活命吗？”甘辉骂屈，英勇义。
甘辉放茶杯：“近试探况，火炮远胜！至少比火炮射程二
十步！双方接战候，至少比打轮炮，死少。”
施瑄：“担！打仗哪死？咱集结船百艘，几倍！硬堆堆死！”
洪旭：“倒真！且咱老兄弟海跳帮、肉搏，帮轻瓜蛋ZI相比强！”
郑芝龙：“错！船、数水本领比强！方担。关键问题两。问题将全体引诱进决战？二问题留？”
郑芝虎粗声：“儿！咱怕！留，留七、八十条船？咱分两队，等埋伏船队咱再！它包住！”
甘辉微笑：“主！咱先六十条船摆波。剩几十条船埋伏。批接战，定将吓跑！”
郑芝龙点头：“办法！剩问题，怎讲引诱决战？”
沉默。海打仗比陆，找片树林，或者山坡藏批马。海平平展展片，很难设伏。
沉默片刻，郑芝风突：“刚给红眼蛇岛怎？次围住岛进攻，红眼蛇调？”
郑芝虎听：“怎？岛围住，消息，红眼蛇怎救？”
郑芝龙脸沉思：“定！定通讯段！次龅牙刚围住岛几，红眼蛇突！结果打龅牙措及，才兵败身死。算间话，应该龅牙刚围住岛，消息送！且，让包围圈缓缓，放几逃送信！”
施瑄拍巴掌：“办法！肯定！”
郑芝凤：“办法倒，岛周边海域广阔，火船办法。”
甘辉：“办法。毕竟火船狭窄海域使。咱，船，直接四围住，火船什
！”
郑芝虎：“干！吗？”
郑芝龙摇头：“急。段间咱连续失利让很眼，再急马很吃力。且李爷刚世，咱海打，李爷老部法。”
郑芝虎瞪眼睛：“眼睁睁条红眼蛇嚣张？”
郑芝龙冷笑：“让嚣张阵谓。正拖段间，清楚谁朋友谁敌？”
郑芝虎拍桌：“太！段间咱吃点儿亏，少三二。股甚至跟红眼蛇边眉眼！若反复交代，早砍！”
郑芝龙摇头：“其实问题身。主因打输。等次彻底打垮红眼蛇，像乖乖听话。”
郑芝虎笑：“错！候非砍几头气！”
郑芝龙哈哈笑：“砍头什思？跪脚边听话才趣！”
众听顿阵笑！笑施瑄：“官，争取朝廷招安，真已经决吗？”
郑芝龙：“错，已经决！且先谣言反帮少忙，快间决！”
洪旭口：“其实赞投靠官府。官决，跟随。恐怕其未必肯跟随啊！”
甘辉：“啊！咱兄弟少官府血仇，很难通。万伤兄弟反！关键，信官府。”
施瑄：“官，招安未必！王海主场吧。官府信！”
施瑄王海主王直。王直徽州(今安徽歙县)。因其外祖姓汪，史料称其“汪直”。嘉靖期与叶宗满等私造海船，犯禁海，经营海外贸易，获甚丰，称五峰船主。勾引倭寇，结巢浙江双屿港。
王直断设法与明朝海、卫官员接近，利力量代其剿除其余海盗团伙，换取明官员感支持，实市交易目。